BioBlender er en softwarepakke bygget på open source 3D-modelleringssoftware.Biologi fungerer på nanoskala med objekter, der er usynlige for det menneskelige øje.Med BioBlender er det muligt at vise nogle af de tegn, der udfylder vores celler, baseret på videnskabelige data og den højeste standard for 3D-manipulation.Forskere over hele verden studerer proteiner på atomniveau og deponerer information i det offentlige depot Protein Data Bank, hvor hvert molekyle beskrives som listen over dets atomer og deres 3D-koordinater .... Med BioBlender kan brugere håndtere proteiner i 3D-rummet, der viser deres overflade på en fotorealistisk måde og uddyber proteinbevægelser på grundlag af kendte konformationer.PDB-filer kan indlæses fra et brugerdefineret bibliotek eller downloades direkte fra PDB-stedet (ved at indsætte PDB-koden).Proteinet vises i 3D (som atomer eller molekylær overflade), og brugeren kan beregne og visualisere dets overfladegenskaber, molekylært lipofilt potentiale og elektrostatisk potentiale.Ved proteinbevægelse beregner BioBlender mellemprodukter mellem to konformationer ved hjælp af Blender Game Engine.Programmet giver som output både de mellemliggende PDB-filer og de gengivne billeder som en film.BioBlender er en implementering af Blender, en open source, frit distribueret, multiplatform, interoperabelt og understøttet program med 3D-animation, visuelle effekter og videospil.Kombinationen af ​​3D computergrafik, spilmotor og videnskabelige programmer gør BioBlender til et komplet instrument til at uddybe bevægelsen af ​​proteiner og til at vise deres overfladefunktioner ved hjælp af en visuel kode baseret på teksturering og partikler specialeffekter.På denne måde er det muligt at vise de fysiske og kemiske egenskaber af et molekyle i bevægelse.BioBlender er resultatet af et samarbejde drevet af SciVis-gruppen ved CNR i Pisa (Italien) mellem forskere fra forskellige discipliner (biologi, kemi, fysik, computervidenskab) og