123
VMD - Visual Molecular Dynamics

VMD - Visual Molecular Dynamics

VMD er i stand til at arbejde med meget store strukturer op til grænserne for tilgængelig hukommelse.64-bit versionerne af VMD tillader simuleringstræk i store størrelser og lang tid at indlæses i fysisk hukommelse og rumme store volumetriske datasæt.Den 64 millioner atom-HIV-kapsidsimulering, der blev beskrevet i 30. maj 2013-udgaven af ​​Nature, er et førsteklasses eksempel på, hvad der kan gøres med VMD på en passende udstyret grafisk arbejdsstation.HIV-1-modellen blev forberedt til simulering under anvendelse af strukturbygningsværktøjer og scripting-funktioner i VMD blev senere anvendt til baneanalyse.Helt atomstrukturen af ​​HIV-1-kapsiden vist på Nature-dækslet blev gengivet inden i VMD under anvendelse af den interne Tachyon-stråle-sporingsmotor og blev derefter sammensat med en kunstnerisk repræsentation af den virale kuvert og Nature-dækningsteksten....

Kategorier

Alternativer til VMD - Visual Molecular Dynamics til Mac

Jmol

Jmol

Jmol er en gratis open source-molekylefremviser for studerende, undervisere og forskere inden for kemi og biokemi.
Rasmol

Rasmol

RasMol er et computerprogram, der er skrevet til visualisering af molekylær grafik, beregnet og brugt primært til afbildning og udforskning af biologiske makromolekylstrukturer ...
pymol

pymol

PyMOL er et kraftfuldt og omfattende molekylært visualiseringsprodukt til gengivelse og animation af 3D-molekylstrukturer.